红与白的搜查档案（ST Aka to Shiro no Sôsa File the Movie）一出交通事故后，国际大都会日本东京被劫持，随后科学搜查班（ST）调查了一起诡异事件。据此，科学搜查班开始研究黑客镝木彻的能力，发现他的行为是有计划、有目的的。ST的领导者决定继续调查，但他们不清楚镝木彻想要什么，他们希望找到他想要的东西。因此，他们决定将整个档案进行深入挖掘，以便找出更多的线索。随着ST的搜查工作越来越复杂，他们必须面对许多问题，包括如何找到线索、如何分析他们的发现以及如何处理证据。虽然有着许多不确定因素，但科学搜查班都有决心和勇气完成他们的任务。